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上海睿远生物医药科技有限公司
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全基因敲除
  • 全基因敲除

全基因敲除

技术简介根据基因的结构特征,选择整个基因,基因组序列作为敲除区域,在基因的5‘和3’UTR区域设计相应的sgRNA,同时构建含与敲除基因5‘和3’临近区域同源的Donor质粒,将Cas9,两条对应的sgRNA和Donor共转染目的细胞


技术简介


根据基因的结构特征,选择整个基因,基因组序列作为敲除区域,在基因的5'和3’UTR区域设计相应的sgRNA,同时构建含与敲除基因5'和3’临近区域同源的Donor质粒,将Cas9,两条对应的sgRNA和Donor共转染目的细胞,通过sgRNA引导Cas9核酸酶对目的基因靶位点进行切割,引起DNA双链断裂(Double-strand  breaks,DSB),通过细胞自身的同源重组修复(Homology-directed  repair,HDR)途径,将Donor质粒重组到目的细胞的基因组中,造成目的基因在基因组序列上的完全敲除,达到基因的完全敲除的效果

全基因敲除(图1)


应用范围


123
基因敲除更彻底,用于基因功能研究,抗体验证等实验时更有说服力适用于存在多个转录本的编码基因的敲除适用于非编码基因的敲除

方案选择


123
拥有质粒瞬转和慢病毒感染两种递送方式,可实现大多数细胞系和干细胞的基因编辑拥有多种荧光筛选标记,结合流式分选,可提高获得阳性目的细胞的概率在细胞不产生耐药的情况下,可提供多种药筛标签,满足不同实验需求。

全基因敲除(图2)

应用案例


细胞名称:Thp-1

基因名称:MIR3945HG

项目方案:构建Cas9/sgRNA过表达质粒和含Donor片段的过表达质粒,转染Thp-1细胞,再通过流式分选对GFP和mCherry阳性的细胞进行筛选,挑单克隆经鉴定后进行扩增,得到MIR3945HG全基因敲除的单克隆细胞株。

全基因敲除(图3)

阳性细胞鉴定:通过对流式分筛选出的单克隆细胞进行PCR及测序鉴定,MIR3945HG基因整个转录本缺失,MIR3945HG基因在功能上到达完全敲除的效果。


全基因敲除(图4)


项目流程与周期



全基因敲除(图5)



交付标准

123
按指定方案构建的目的基因编辑细胞株,每个目的细胞株交付基因型正确的2个克隆,每个克隆2支冻存细胞(1×10⑹cells/支)对照细胞株,瞬转方案为对应野生型细胞,慢病毒方案为Cas9稳转细胞项目报告及质检报告

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